Se voce como eu acessa o DB2 no mainframe usando JPA-Hibernate e enfrentou problemas com o entity manager, aqui vai a dica...
O problema nao e no Java ou no JPA e sim a falta de PTF's que a grosso modo sao como services packs do windows, que deixam o DB2 pronto para uso do JDBC tipo 4.
Aqui vai os links que lhe serao uteis para a configuracao do DB2, sao todos diretos do site da IBM :
http://publib.boulder.ibm.com/infocenter/db2luw/v9r5/index.jsp?topic=/com.ibm.db2.luw.apdv.java.doc/doc/r0023708.html
http://publib.boulder.ibm.com/infocenter/db2luw/v9r5/index.jsp?topic=/com.ibm.db2.luw.apdv.java.doc/doc/rjvxindt.html
Com a informacao destes links voce sabera o PTF certo para cada versao do DB2 e tambem para o ambiente iZ/390.
Apos a instalacao e configuracao dos mesmos e so rodar o seu sistema, ou mesmo conectar via IDE que tudo funciona perfeitamente.
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